“唉！我可以允许你，招募大家族的旁系子弟，千手不能动。”猿飞日斩妥协了。
根组织比暗部隐藏得更深，所做的事也更加见不得光。因得到三代目火影·猿飞日斩的默许而长期存在。团藏和根成为了木叶最直接有效的利剑，以“宁错杀，不放过”的姿态铲除村内外一切威胁。
这让猿飞日斩在短短几个月内，掌握木叶大权，开始实行各种政策。
团藏为了实现自己对忍者的理想，所以成立了暗部养成部门。这个组织位于木叶的影子底下，将树根深深扎进黑暗里，最大的目的就是在暗中消灭会妨碍村子繁荣的障碍。为此，他们执行任务时不择手段，这正象征着团藏的“忍之黑暗”，是一个无情且残酷的组织。
由于猿飞日斩在继任火影后没能延续二代目火影·千手扉间冶理宇智波一族的基本方针，导致让志村团藏背负起了村子的黑暗，团藏由此获得以暗部培训部的名义成立了隶属于自己的独立组织“根”的权利。
的队员是由团藏直接招募，他选择的对象是具有特殊能力的人，以及心中有黑暗的人等等......队员需要接受“消灭自我“的训练，为了守密，也会对他们施加咒印，段藏彻底将他们培养成执行任务的棋子。所谓“根”之人，没有名字、亦无感情。没有过去，无未来。心中只有任务，在背后支撑起木叶村这棵大树的是深扎于大地之中的……我等“根”的意志。。
《舌祸根绝之印》木叶暗部“根”专用的封印术，团藏对根成员的舌头上加上咒印，被施术的人要是说了任何有关他的事，就会全身麻痹，既说不了话，也动弹不得。团藏此用来束缚自己部下，让他们不能说出有关自己的秘密。
日斩是阳光下永远温暖的火影，团藏是黑暗中杀伐果决的根。