护教军是机械神教所掌握基础武力，大多数护教军被部署在他们所属的铸造世界上。但也有少部分护教军为取得他们主人所需要的的知识，满银河系的乱跑，在各种星球上考古打仗。
护教军和他们所效忠的贤者主人一样，用神圣的机械取代了自己的部分躯体。他们以强化义肢替换了血肉，并根据自己在护教军中的定位进行了如眼部改造强化，额外的机械臂强化，脑中植入通讯连接器等多种改造。
护教军被创造出来本质，就是杀人和被杀，这些可以为万机之神的信仰而死的殉道者，仅仅将自己当做是机械的怒火显现于世的工具。
他们在贤者的指挥下前仆后继的不断向敌人发起攻击，直到敌人变为血水或化为灰烬。对自己的伤亡则从不在意，只在乎完成贤者们的任务。一切都是为了欧姆弥赛亚的意志服务，这对他们来说已经足够。
此时攻入敌方舰船的护教军们在各个神甫的指挥下展开了对叛徒们的攻击。
其实，被混沌腐化的仅仅只有一些海军高层，他们手下的大多士兵不过是听命行事罢了。一艘舰船上的船长就如同一位国王，管理着舰船上数万人的方方面面。
当船长下令对帝国的铸造世界进行轰炸时，那些一辈子从未离开过舰船的船工和水手哪里知道什么对与错，这不是他们这个身份的人该想的事情。他们的脑子里只知道必须执行来自船长的命令，不然将被船上的武装水手击毙。
而那些听命于船长武装水手们其实也并不比底层的船工懂得更多。他们同样受到了海军高层的蒙蔽，根本不知道自己发誓要守护的星舰在船长的命令下做出了何种叛逆行为。
一些有能力知晓船长已经叛变帝国的忠诚海军士官，还没来得及有所动作，便被那些真正叛变的舰船海军高层污蔑为叛徒，原地枪毙或受到各种追捕，只能躲在舰船的甲板下层。
往往在犯下多起不可饶恕的行为后，这些舰船上的成员可能才意识到自己的所作所为到底代表着什么。可往往当他们发现这些的时候，已经无法挽回了，帝国早已将他们视作叛徒，无法原谅。此时他们早已没了选择，只能一条路走到黑。
前来围剿他们的审判庭和阿斯塔特战士不会在乎他们是不是身不由己，是不是有苦难言，帝皇的忠诚战士只在乎是否将永恒的死亡带给了那些帝国的叛徒。
此时被机械教护教军进攻的武装水手们，心中已经隐隐觉得有些不对，但在混乱的战场上，他们也没时间想更多事情。
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