当机立断带领亲兵驾马向南奔逃，摆脱了敌军的追击，因此，朱温躲过一次杀身之祸！
乾宁元年（894年）二月初，经过几个月休整后，朱温亲自率领大军从郓州东路向北到达鱼山，准备一举歼灭朱瑄军！
朱瑄侦察到朱温军动态后，朱瑄也领兵直奔鱼山，准备与朱温进行决战！
两军在鱼山地区相遇，激战立即展开！
最终，朱瑄兵败，被杀死将士一万多人，朱瑄的残兵拥挤着进入清河城！
朱温在鱼山下收聚敌尸筑起高大的坟墓以记战功，驻军几天后返回。
乾宁二年（895年）正月二十九日，朱温派朱友恭率领军队攻伐兖州，挖成堑壕围住兖城。
不久，朱瑄从郓州率领步卒骑兵运送粮食支援，他们急于想进入兖州！
朱友恭是朱温军足智多谋的优秀将领，他指挥部队在朱瑄军的必经之路上埋下伏兵，击败了朱瑄军！
同时，朱温军将领高吴全部夺取了朱瑄军的军粮，趁机俘虏了蕃将安福顺、安福庆。
乾宁二年（895年）十一月，朱瑄派部将贺瑰、柳存以及蕃将何怀宝等一万多人袭击曹州，想解除兖州的围困。
朱温闻讯后，从兖州带领军队策马飞奔到钜野南边，击败了他们，活捉贺瑰、柳存、何怀宝及残余三千多人。
乾宁四年（897年）正月，朱温率领洹水的军队大举攻伐郓州。
同年同月十五日，在济水旁边安营扎寨，庞师古命令诸将撤下各种树木搭起桥梁。
同年同月十九日夜晚，庞师古率领中军先渡过济水，呐喊声震撼郓城，朱瑄听到后，弃城夜逃。
葛从周追到中都北面，抓住了朱瑄和他的妻子儿女献上，立即被诛杀在汴桥下面。郓州平定。
同年同月二十三日，朱温进入郓城，任命朱友裕为郓州兵马留后。这时朱温听说朱瑾与史俨儿在丰、沛一带搜括军粮，只留下康怀英据守兖州，朱温因而乘胜派遣葛从周带领大军袭击兖州。
康怀英听说郓城失守，接着又有葛从周大军来临，就出城投降。
朱瑾、史俨儿便逃奔淮南。郓州、兖州平定。
朱温以葛存周任兖州留后，他率军返回治所汴梁城。
朱温通过几年中原逐鹿战，彻底消灭了朱瑄、朱瑾等军阀势力后，除了山西李克用、河中王珂等军阀仍然与朱温为敌之外，其他中原军阀都臣服在朱温的脚下，向朱温进贡税赋，听从朱温的调遣
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