其遗孀大夫人苏泰和长子额哲率察哈尔和鄂尔多斯部返回鄂尔多斯草原，却图台吉则进入了青海，造成了对明朝边镇的冲击力度。
西元1636年3月，在得到漠南蒙古16部49人的拥戴后，皇太极正式称“博格达彻辰汗”，改国号为“清”，改元“崇德”。于是，漠南蒙古全部归顺“满清”，而清朝也将皇太极的次女嫁给额哲，并册封额哲为“亲王”，将察哈尔分为8个旗，设“都统”和“副都统”进行管辖。当然了，满洲贵族还分别娶了林丹汗的“八大福晋”。
所谓“娶了林丹汗的‘八大福晋’者”，其实就是把“蒙古大汗”的老婆们瓜分殆尽，毕竟在草原游牧民族严重，女人的生育能力与猪、马、牛、羊、骆驼等牲畜能为人类提供生存资料一样，也是一种“重要资产”。
于是，从西元1206年——西元1635年，“成吉思汗”所建立的“大蒙古国”寿终正寝。到了西元1641年，额哲去世后，其弟阿布奈继承袭爵，惟有阿布奈其子布尔尼作乱，被康熙帝处死，使“察哈尔亲王”被废。
纷纷扰扰四百年，“大蒙古国”的历史有过辉煌，有过衰败，有过非“黄金家族”的鬼力赤和也先称雄大漠，也有“黄金家族”的“达延汗”和“俺答汗”热衷恢复“元朝”，更有“满都海夫人”和“三娘子”这等蒙古女英雄！
但是，他们的业绩都已经烟消云散，只留下草原上的敖包静静矗立，告诉后人这片土地上的曾经发生过的盛衰兴亡，但在中国古代历史上，农耕民族和游牧民族的战争总是持续不断的进行着，就比如现在。
秦汉和匈奴、隋唐与突厥、两宋和辽金、明朝和满蒙，都曾经上演了长期的对峙和拉锯。到了明朝，北方大漠成为了蒙古人的天下，而明朝和蒙古在“边墙”（长城）上下对峙了200多年，这还不包括“后金”。
西元1368年，朱元璋的大军攻破了北京，标志着元朝作为当时的大一统王朝正式宣告灭亡。同年，朱元璋在南京称帝建立“明朝”。元朝灭亡后，蒙古势力基本退回大漠，但尚未放弃“元朝”国号，史称“北元”。
于是，朱元璋时期对蒙古的战争，主要就是用武力逼迫逃回大漠草原的蒙古人放弃“大元”这个国号。
西元1369年，朱元璋派遣常遇春、李文忠率领步兵8万、骑兵1万进攻“北元”上都开平。这次出征很顺利，因为城破之前，元顺帝孛儿只斤•妥欢帖木儿就被迫逃亡到应昌（今内蒙古赤峰）。据说，元顺帝当时还作下一首
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