件事变成了文人的纸上乐趣，而且到了明末之时，文官党争严重，常常耽误正事，也因此打了不少败仗。
至于用宦官监军比表面看也很不错，可问题是太监无军事常识，又因为身处深宫，对于战场局势常常缺乏判断能力，而且这些人贪腐成性，经常向前方将帅所贿，自然也不在林敬的考虑之中。
当然，这也是因为一些时代因素所造成的问题，毕竟在冷兵器时代里，不存在真正超越个体能力的作战方式，因此指挥者能做的事情其实很有限，而庞大的军队终究需要分别控制，这就给私兵形成了空间。
在摈弃了这两种监军制度后，林敬反复思考了许久，他结合了后世的军事制度，决心将抗虏军的重要组成部分单独划分出来，在抗虏军将领层级之上形成一个新的都督府。
在新的抗虏军都督府中，林敬决定设置参谋司、军情司、军械司、军法司、军需司以及总务司。
其中参谋司便是将目前抗虏军的参谋制度全面施行，从而尽可能地将策划权归拢到参谋司，仅仅只留下决策权给军事主官，从而减少决策的漏洞;
原本军情司跟军情处的地位发生了重叠，但是由于抗虏军只是目前林敬手中掌握的唯一的一个军，将来或许还会有新的军，到时候就不太适宜，因此最好是每个军中都有单独成立的军情司，负责一部分军事情报工作。
至于军械司则是直接对接枪炮厂，负责所有新式火器的采购，包括一些其他兵器的添置，并且还需要负责新式武器在战场上的使用报告，督促完成改进。
军法司则是负责所有军官和士卒的司法、刑罚、审判、监狱事务。
军需司便是负责整个大军的后勤保障工作，这也是林敬相当看重的一部分。
至于最后的总务司，则是负责整个大军的所有士卒的军饷发放，个人功绩的评定，算得上这一次改革的头号部门，也是林敬必须要牢牢抓在手中的部分。