确实功劳很大。可是这些人都被赵高收买了，他们早就把这话报告了赵高。赵高听说二世对他不放心，还要派专人去复审李斯，就赶紧派人再去审讯李斯。这些人就冒称是从宫里来的，说是奉诏复审李斯。李斯听了这话，心里很高兴，认为这下可能要澄清冤屈了，就如实地向审讯的官员作了汇报，说自己并没有怂恿李由造反，前面的供词全都是郎中令赵高屈打成招，李斯就强烈地要求官员，把这些实情向皇帝奏明，为他申冤。可是审讯结束后，谁知官员又将李斯一顿暴揍。李斯感到莫名其妙，只好大叫：“冤枉！”可是越是喊冤枉，就越被打得厉害。结果一百鞭子下来，李斯又被打死过去。狱卒又用水泼醒李斯，喝斥他为什么不说实话。李斯疼痛难忍，就只好改口道：“自己是楚人，因为念及乡党才和楚人私通！自己也曾经怂恿过儿子李由，叫他不要和楚人为敌。”狱卒听了这话才罢手了，就对李斯道：“你记住，不管什么时候，只要有人问你，你就这样回答，就不会有人打你了！”李斯只好答应了下来。爪牙们就让李斯画了押，然后才离去。前人有诗哀叹道：
严刑峻法任君施，祸报临头悔已迟。
家族将夷犹惜死，桁杨况味请先知。
当天晚上，赵高担心李斯还要翻供，就又指使一个官员连夜去密访，谎称是以前被李斯救助过的家奴，特来看望主人。李斯也想不起自己什么时候帮助过他，认为是天命不绝，便鼓足气力，挥泪写了一份情真意切的奏章，内容是：
罪臣担任丞相，治理国家已经三十年了。先帝的时候，秦国的土地不过千里，军队也只有几十万人，臣下竭尽微薄之力，谨慎地奉行诏令，对外暗中派遣谋士，给他们大量的金银珠宝去游说诸侯；同时对内加紧操练军队，整顿政治，教化民众，任用勇猛善战的才士做官，还尊崇有功之臣，提高爵位和俸禄，所以最终征服了六国，统一了天下，先帝做了始皇帝，这是臣的第一条罪状。建国之初，虽说秦国土地宽广，可是臣又担心南北少数民族的侵扰，于是也同意先帝派兵驱逐匈奴，平定百越，使秦国更加强大，疆域北起阴山，南到大海，这是臣的第二条罪状。建国之后，又重贤用能，尊崇秦国的有功之臣，提高他们的爵位，使君臣关系更加亲密，这是臣的第三条罪状。又帮助先帝确立了社稷的祭奠，修明了宗庙的奉祀，在全国推行郡县制，来昭彰君上的贤能，这是臣的第四条罪状。臣又改定器物徽识和纹饰的款式，统一了度量衡，制定了律令和礼乐制度，还规定了文字的标准与写法，发展了秦国的文化，这是
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